当时户部侍郎的他也意识到，中国的户籍管理很乱，要建立这种累犯的档案“非先编户口，岁列统计”不能编写，所以他认为“户口不清，万事无从下手，宁独检案一事而已耶？”因此，整理户籍、建立合理的户籍制度成为首当其冲的事情。

    接下来的汉堡警察局参观中，他看到国外用指纹法来定案，之后在戴鸿慈的要求下去参观了汉堡的一个区级注册所，看到这里的户籍非常详细，而且户籍管理政策也比较严密，鸿慈在此又看到了整理户籍的重要性和紧迫性，戴吴团回国不久，清政府即着手开始对户口的清查。这些方面吴宸轩也吩咐人做好记录，虽然吴宸轩在山东已经披着保甲法的皮，搞起来的城乡户籍制度，不过这一切都是为了军队兵役制度服务的，所以对于非兵役对象的老弱妇孺都没有统计的太详细，更不用说什么犯罪记录之类了。反正照相术已经成熟了，吴宸轩觉得自己回去在山东推行身份证制度算了，至于户口本也可以有，而且对于乡村中的宗族势力早就不爽的他觉得按照户口本来划分家庭比较适合商会的需求，毕竟没有工会的情况下，能对抗资方的也就是宗族势力了。从政府方面而言，政令不下乡的主要问题就是缺乏人手和宗族势力的包办，正好一并解决，就算是收税也可以多收一些。
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